С первых дней своего существования Институт Стран СНГ активно подключился к вопросам защиты прав русских и русскоязычных граждан Украины, проблеме статуса Севастополя и Крыма, проблеме единства Русской Православной Церкви. Отдел Украины Института консультировал практически все действующие и создаваемые русские и пророссийские организации Украины- Гражданский Конгресс, Русскую Общину Крыма, Конгресс русских организаций Украины, «Родина» и многие другие, православные организации «Путь православных», Союз Православных Граждан Украины и т.д.
Институт Стран СНГ издал сборники «Испытание Украиной» (М. 1997), «Обман века»(М, 1999), « По следам «оранжевой революции»: Украина между Востоком и Западом», совместно с редакцией НГ выпускал приложение к «Независимой Газете» «НГ- Содружество».
Институт Стран СНГ возглавил информационную и общественно-политическую патриотическую дискуссию против ратификации «Большого Договора» между Россией и Украиной. Предостережения экспертов отдела о негативных последствиях ратификации этого договора , к сожалению, подтвердились, Украина еще быстрее пошла по пути трансформации в антироссийское государство.
К сожалению, подтвердились и предупреждения экспертов Института об угрозе и возможных последствиях «оранжевой революции» на Украине, о катастрофических последствиях попыток Л. Кучмы удержать власть, о недостаточной готовности «антиоранжевых» сил к использованию эффективных политических технологий, о мировоззренческой невнятности как факторе поражения и т.д.
На эту тему было написано множество докладов и экспертных заключений, сделано много резонансных публикаций.
В центре внимания Отдела- проблемы прав и свобод русского, русскоязычного и русинского населения Украины. Справки и публикации Отдела по этой теме имеют широкий резонанс, активно используются в формировании официальной позиции России.
Такая же важная проблема – недопущение отрыва Украинской Церкви от Московского Патриархата. Единство Русской Православной Церкви –это важнейший фактор, препятствующий превращению Украины в антироссийское государство. Отдел Украины анализирует ситуацию в этой сфере, его эксперты активно публикуются по проблематике цивилизационного, духовного единства России и Украины.
Отдел Украины активно участвовал в научных работах по опровержению политики «оранжевых» властей Украины по фальсификации истории и попыток создать и России образ врага.
Институт Стран СНГ проводит постоянный мониторинг, анализ и прогноз политической ситуации на Украине и после выборов Президента В. Януковича, исходя из базовых интересов России.
В Институте создан уникальный коллектив специалистов, поэтому основное пожелание- расширение информационной и издательской деятельности Института.